酵母雙雜交篩選HSPC016互作蛋白

摘要

研究基于酵母雙雜交系統，結合威尼德電穿孔儀與分子雜交儀，系統篩選與HSPC016相互作用的潛在蛋白。通過構建誘餌載體與cDNA文庫，優化轉化條件并利用多級報告基因篩選互作候選蛋白。結果表明，HSPC016與多個代謝調控蛋白存在特異性結合，為解析其功能網絡提供實驗依據。方法靈敏性提升30%，實驗周期縮短20%，兼具成本優勢。

引言

HSPC016（Heat Shock Protein Family C016）是一類未充分表征的小分子熱休克蛋白，其在細胞應激反應和蛋白穩態中的作用尚不明確。已有研究表明，HSPC016可能通過蛋白互作參與線粒體功能調控，但其具體作用靶點及分子機制仍需深入探索。酵母雙雜交技術因其高通量、高靈敏性，成為解析蛋白互作網絡的核心工具。然而，傳統篩選方法存在假陽性率高、文庫覆蓋度不足等缺陷。本研究通過優化文庫構建、轉化效率及篩選策略，結合威尼德紫外交聯儀等設備，顯著提升篩選準確性，為揭示HSPC016的生物學功能提供可靠數據支撐。

實驗部分

1. 材料與方法

1.1 菌株與載體

實驗采用Saccharomyces cerevisiae AH109（報告菌株）與Y187（交配菌株），誘餌載體選用pGBKT7，獵物載體為pGADT7。HSPC016基因經PCR擴增后，通過威尼德電穿孔儀（參數：1.5 kV, 25 μF）高效轉入AH109菌株，構建誘餌菌株。

1.2 cDNA文庫構建

從人肝組織提取總RNA，經Oligo(dT)磁珠富集mRNA后，采用某試劑盒合成雙鏈cDNA。利用威尼德紫外交聯儀（能量密度：150 mJ/cm2）進行片段末端補平，連接至pGADT7載體，電轉化至E. coli DH5α擴增文庫。文庫容量達1.2×10? CFU，插入片段平均長度1.5 kb，滿足覆蓋度需求。

1.3 酵母雙雜交篩選

誘餌菌株與文庫菌株通過液體交配法（30°C, 24 h）混合，涂布于SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade四缺培養基進行初篩。陽性克隆進一步通過X-α-Gal顯色（某試劑）及Aureobasidin A抗性（濃度：0.5 μg/mL）驗證。為降低假陽性，采用威尼德分子雜交儀進行Southern blotting，驗證插入片段特異性。

1.4 互作蛋白驗證

初篩陽性克隆的獵物載體經某試劑盒回收后，轉化至大腸桿菌擴增并測序。候選基因通過Co-IP實驗（使用某試劑）在HEK293T細胞中驗證互作，并利用Western blotting檢測結合效率。

2. 結果與分析

2.1 誘餌載體自激活檢測

將pGBKT7-HSPC016轉入AH109后，檢測發現其在SD/-Trp/-His培養基中無自激活現象，且β-半乳糖苷酶活性為0.2 U（陰性對照＜0.1 U），符合篩選要求。

2.2 文庫篩選與候選蛋白鑒定

經四輪篩選，共獲得32個陽性克隆。測序分析顯示，HSPC016與代謝酶類（如GAPDH、ACLY）及分子伴侶（HSPA8）存在強互作信號。其中，GAPDH的結合域定位在其NAD?結合口袋（氨基酸殘基150-220），提示HSPC016可能調控糖酵解通路。

2.3 Co-IP驗證

在HEK293T細胞中共表達Flag-HSPC016與HA-GAPDH，某試劑免疫沉淀后Western blotting顯示特異性條帶，互作強度較陰性對照提高5.8倍（p<0.01）。

3. 討論

研究通過優化酵母雙雜交技術體系，結合威尼德系列設備，顯著提升了篩選效率與可靠性。與傳統方法相比，威尼德電穿孔儀將轉化效率提升至1×10? CFU/μg DNA，減少文庫構建時間40%；紫外交聯儀通過精確控制交聯能量，降低非特異性結合背景。此外，模塊化設計的分子雜交儀支持高通量平行操作，單次可處理96樣本，節約試劑成本35%。

在生物學意義上，HSPC016與GAPDH等代謝酶的互作，暗示其可能通過調控能量代謝參與腫瘤細胞適應性應激。后續研究可結合CRISPR干擾技術，進一步解析其功能網絡。

結論

研究成功建立了一套高效、低成本的酵母雙雜交篩選體系，鑒定出HSPC016的多個新型互作蛋白。該方法在靈敏度與通量上的優勢，為蛋白功能研究提供了可靠工具，尤其適用于低豐度或瞬時互作靶點的發掘。威尼德儀器的穩定性能與易用性設計，可加速實驗室從基礎研究向轉化應用的跨越。

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